一、样品要求:
1.IP、co-IP、Pull-down等方法制备的蛋白质复合物;
2.蛋白胶带样品,包括考染、银染;
3.细胞或组织总蛋白,蛋白总量200ug以上;
4.抗体等大分子蛋白。
二、仪器性能:
1.离子源:加热温度>350℃;
2.分辨率:谱图采集速度≥50张谱图/秒时,TOF不低于45000;高灵敏MS/MS模式不低于25000(FWHM),高分辨MS/MS;
3.模式不低于30000(FWHM);
4.谱图采集速度:在分辨率不低于40,000的情况下,采集速度≥每秒50张谱图,即扫描速度≥50Hz。
1.质量分析器:离子导入设计保障更多离子进入质谱,方便清洗维护;
2.四级杆Q1母离子的选择范围:低质量端m/z不高于20,高质量端m/z不低于2250;
3.质量精度:MS和MS/MS模式下,外标法校正误差 ≤2ppm,内标法校正误差 ≤0.8ppm;
4.质量稳定度:连续8个小时以上进样误差 ≤2 ppm;
5.检测器:采用数字转换器技术,采集频率≥5GHz;
6.工作流程:具有定性、定量和同时定性定量三种工作模式。
三、仪器应用:
1.分子式确认和未知物分子式推断;
2.化合物的表征和定性;
3.代谢物分析;
4.代谢组学;
5.蛋白质组学,包括蛋白鉴定,翻译后修饰鉴定,糖基化分析等;
6.定量蛋白质组学,包括非标定量和标记定量法;
7.整体大蛋白分析。